Pupenu kapsēta atrodas blakus Asotes pilskalnam. Nosacīti tā iedalās vecajos kapos, vidējos un jaunajos kapos. Pēc konfesionālās piederības tā ir luterāņu kapsēta, kuru pārvalda Krustpils luterāņu draudze.

Pupenu kapsētā apbedīti aviācijas konstruktors un pirmais latviešu lidotājs ar gaisa balonu Kārlis Skaubītis, Triju Zvaigžņu ordeņa kavalieris kapteinis Jānis Alfrēds Bērziņš, skolotāji -  Gaļina Skudra un Jānis Saulītis.